Molecular taxonomy and phylogenetics of Daedaleopsis confragosa (Bolt.: Fr.) J. Schröt. from wild cherry in Serbia

Abstract

© 2018 Serbian Genetics Society. U radu su prikazani rezultati dve morfološki različite lignikolne gljive Daedaleopsis confragosa i Daedaleopsis tricolor izolovane iz maticnih populacija divlje trešnje (Prunus avium L.) pronadene na lokalitetima zašticenih šuma Srbije čineci značajne ekonomske štete u dekompoziciji vrednog drveta ove biljne vrste. Morfološki izgled D. tricolor bio je prevalentan u poredenju sa vrstom D. confragosa. Uzorci iz Srbije analizirani su pomocu morfometrijskih i molekularnih metoda i uporedeni sa izolatima iz Velike Britanije i objavljenih sekvenci iz Švedske, Austrije, Madarske, Nemacke, Kanade, Francuske, SAD i Češke da bi odredili taksonomsku pripadnosti i njihovu genetsku povezanost koristeci ITS rDNA barkod region u genomu istraživanih gljiva. Rezultati BLAST pretraživaca sekvenci izolata potvrdili su morfološku karakterizaciju njihovoj taksonomskoj pripadnosti za vrstu D. confragosa dok je analiza sekvenci pokazala mutacije na polimorfnim pozicijama koje ukazuju na geneticku divergentnost za varijetet D. tricolor. Filogeneticka analiza je pokazala usku genetsku srodnost srpskih izolata sa izolatima iz Velike Britanije, dok je razlika znacajna u odnosu na sekvence izolata drugih zemalja ukljucenih u istraživanja. Za buduci rad potrebno je umnožiti varijabilne regione obe vrste gljiva u cilju procenjivanja njihovih vrsnih granica ili primeniti nove NGS tehnologije za dublju i detaljniju analizu sekvenci.